Praxisbeispiel: GC/MS Messwerte in Ihr LIMS System importieren


Im folgenden Praxisbeispiel zeigen wir Ihnen, wie Sie gängige MS GC/MS-Analysegeräte (Gaschromatographie/Massenspektrometrie) z.B. von Thermo Fischer per Schnittstelle direkt an Ihr LIMS anbinden und automatisch Messwerte importieren.
Jedes Analysegerät, das eine Exportdatei mit Messwerten generiert, kann an die Labordatenbank angebunden werden. Um Ihr vorhandenes GC/MS Analysegerät an Ihr Labordatenbank LIMS anzubinden, benötigen Sie eine Exportdatei und Zugriff auf die Labordatenbank LIMS Importschnittstellen. Die Exportdatei können Sie direkt in der GC/MS generieren. Die Labordatenbank Importschnittstellen finden Sie unter Menüzeile -> Proben -> Importschnittstellen.

Zur Anbindung Ihrer GC/MS führen Sie als nächstes die folgenden sechs Schritte aus:

1) Sichten Sie als erstes die Exportdatei. Im folgenden
In Excel:


In einem Text-Editor:


Dabei fallen folgende Auffällgkeiten auf:
  • Es ist keine Probennummer zur automatischen Zuordnung vorhanden

  • Die Attributszeile ist in Zeile 8
  • Als Trennzeichen wird TabStop verwendet
  • Nicht alle Zeilen haben ein Ergebnis
  • Nicht für alle aufgelisteten Parameter wurde von der GC ein Peak / eine Konzentration ermittelt


2) Legen Sie eine neue Importschnittstelle an.
Geben Sie die Eigenschaften der zu verarbeitenden Datei an


3) Laden Sie die Datei als Muster-Datei hoch


4) Legen Sie im Importmapping fest, welche Informationen aus der Datei welcher Stelle in der Labordatenbank zugeordnet sind


5) Laden Sie bei einer Beispielprobe die Messdatei Ihrer GC hoch


6) Überprüfen Sie den Import


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